松果体细胞瘤不是属于先天性的疾病，目前对于松果体细胞瘤的病因还不能明确，有一些学者认为松果体细胞瘤，是人体在后天接触一些放射性元素，或者是能够改变体内细胞类型的元素，所以导致松果体细胞瘤的产生。
还有一部分人认为与染色体基因学和家族有一定的相关性，所以目前松果体细胞瘤的病因，并不能明确是不是先天性。但是松果体细胞瘤虽然是属于肿瘤的范围，是属于良性肿瘤，一旦诊断之后最好是尽快手术治疗，如果处理不及时的情况下，有可能出现瘤细胞的转移。
松果体细胞瘤瘤细胞的转移和其他肿瘤转移性质不一样，它会引起症状复杂结局，但是不会像其他肿瘤一样对周围组织造成强烈的破坏出血。