输尿管的结石需要根据结石的大小、产生的临床症状，以及残留的时间来确定。
对于新发的、体积小于0.6厘米的输尿管结石，可以保守治疗，给予药物排石。当结石存在的时间超过两周，或者已经引起了比较严重的肾脏积水、肾周积液，或者产生了发热等全身症状时，此时即使小于0.6厘米的结石也应尽早行手术治疗。如果感染比较严重时，可以先一期留置输尿管支架引流肾积水，待二期手术治疗。
输尿管上段的结石超过0.6厘米，可以选择体外冲击波碎石或输尿管软镜治疗，0.6厘米以上输尿管下段结石可直接行输尿管镜手术治疗。