后纵隔囊肿的临床表现为压迫、呼吸道症状、感染、神经系统症状、特殊症状等。压迫症状是由于上腔静脉受压、气管受压、食管受压，出现的下咽梗阻、气急等表现。
呼吸道症状多见于病侧胸部或胸骨后，有胸痛、胸闷症状。多数因恶性肿瘤入侵神经或骨骼，引发的剧烈疼痛感。通常咳血少见，咳嗽较多见为肺组织受压或气管受压所引起。当后纵隔囊肿感染、囊肿破溃，影响到肺组织和支气管时，就会出现与之关联的感染表现。神经系统症状为引发声音嘶哑，为肿瘤侵犯喉返神经所引起的。