肛周肿瘤按组织类型可分为三种类型：
第一种类型，鳞状细胞癌。是肛周肿瘤最常见的组织类型，约占肛周肿瘤的百分之八十。 鳞状细胞癌多发生在肛门周围，来源于角化上皮且分化良好。
第二种类型，基底细胞癌。也称为移行癌性、泄殖腔源性癌，多位于肛管部位，来源于非角化上皮而且分化差。
第三种类型，肛门腺癌。是一种非常罕见的肛门肿瘤，来源于肛瘘和低位直肠肿瘤的胶样癌。
肛周肿瘤的治疗根据其组织类型及肿瘤侵犯的范围，而定治疗方案。治疗的原则是提高治愈率，而尽可能不选择破坏性的手术方法。