临床上甲胎蛋白指标正常也有可能患有肝癌。
这是因为甲胎蛋白虽然是辅助诊断肝癌的重要肿瘤指标，但并非所有的肝癌患者都会出现这项指标的异常。研究发现一般70%左右的肝癌患者，空腹抽血化验可以出现这项指标异常，还有30%左右的患者，甲胎蛋白检测是阴性结果。因此，不能单纯依靠这项指标正常就排除肝癌。
甲胎蛋白指标异常还见于一些肝硬化、慢性活动性肝炎等非肝癌的疾病，因此，临床上同样不能仅通过这项指标的异常，就判断患有肝癌。