精子畸形率97%有可能怀孕，但是自然怀孕的概率极低。即使能够怀孕，妊娠期发生流产、早产的几率增加，并且孩子的出生质量下降。
由于该测值低于新版正常精子形态率参考值的40%，需要进一步辅助阴囊彩超、前列腺液化验等相关检查。明确致病菌感染、炎性刺激导致的精子畸形率测值异常，需要针对性抗炎治疗。同时还需要及时脱离高温、油漆，以及电焊等有毒、有害环境。
由于相关不良因素刺激，可导致精子尾部以及头部畸形率增加，影响跟卵子的结合，导致受孕概率下降。