龟头起小红疙瘩，首先应考虑可能为包皮龟头炎所引起，由于龟头局部存在炎症反应，炎性物质的刺激容易诱发炎性结节，可在龟头皮肤表面出现小疙瘩，同时还可伴有明显的瘙痒、疼痛表现。应积极进行抗菌、消炎治疗，促进炎症快速消退，小红疙瘩也会逐渐消失。
其次，可能为尖锐湿疣所引起，属于人乳头瘤病毒感染所引起，是一种性传播疾病，有着较强的传染性，可在龟头局部出现类似菜花样凸起物的小疙瘩，在确诊后应积极对症治疗。
另外，还可能为阴茎肿瘤所致，可通过病理活检明确诊断，确诊后积极进行手术治疗，并配合放疗和化疗。