肾结石手术不是一定要把结石取出来的。目前临床上肾结石的手术可分为两种：
第一种，是输尿管软镜下肾结石碎石术，将输尿管软镜自尿道、膀胱，送入输尿管、肾脏内，利用较细的钬激光将肾结石粉末化，由于软镜的管径狭窄，不利于取石，所以将结石粉末化后还需要自体排石的过程。
第二种，是经皮肾镜下肾结石碎石、取石术，适合于较大的或者复杂性的肾结石，经皮肤穿刺进入肾脏，扩大穿刺通道后将肾镜置入肾内，用钬激光将结石粉碎后，用取石钳夹出，这种手术方法是需要把结石取出来的。