1.萎缩胃炎主要的病因是和饮食有关系，如果长期吃过热的食物，或者是过咸的食物，生冷的瓜果之类的，容易刺激胃粘膜，导致慢性萎缩性胃炎的发生，或者长期服用一些药，容易刺激胃粘膜。
2.还有一种情况就是和免疫因素有关系，或者是和胃十二指肠反流这种疾病也是有关系的。
3.还有一部分患者有幽门螺旋杆菌感染的时候，会容易导致萎缩性胃炎的发生，因为有幽门螺旋杆菌感染的时候，这种杆菌分泌物中的毒素，美军等可直接伤害胃粘膜上皮细胞，长期的不愈合，会引起萎缩性胃炎。