减肥药吃完也会有副作用的。临床上比较常用的减肥药，就是奥利司他，也会有副作用。
一般比较常见的是胃肠道不良反应，包括恶心、呕吐、腹痛、脂肪便、稀便、软件、大便次数增多，油性呃逆。还会表现为呼吸道感染，包括上呼吸道感染和下呼吸道感染。有的人还会出现头痛、疲倦、焦虑，泌尿系感染月经失调等。有一些人会出现过敏反应，皮肤瘙痒、皮疹、荨麻疹、血管神经性水肿。
减肥药还可能引起质溶性维生素的血浆浓度下降，尤其是维生素e，所以还需要适当的补充维生素。