如果相对比较小的卵巢囊肿，没有相应的临床症状，只是在做妇科检查的时候才被发现有囊肿的现象，就建议暂时不用手术，可以定期地做妇科检查。
如果是相对比较大的卵巢囊肿，比如直径大于5cm的情况下，或者有相应的临床症状，就建议可以考虑手术治疗，临床上常用的就是腹腔镜手术，另外，相对比较大的囊肿，也建议可以做开腹手术进行治疗，这样视野会更清楚一些。
卵巢囊肿到目前为止病因还不清楚，但是有一些卵巢囊肿虽然是良性的，但是有可能会发生恶性变，所以一旦具有手术指征的情况下，就要积极的手术治疗。另外，在发现卵巢囊肿之后，也建议做妇科肿瘤三项的化验检查，主要是了解是否有恶性的可能性，然后再决定下一步的治疗。