由于新型冠状病毒肺炎，它的传播途径主要是呼吸道传播和接触传播，所以首先影响的是肺。新型冠状病毒肺炎它可以分为轻型，普通型和危重型，一般来讲，轻型和普通型患者愈后是比较好的，不会有一些并发症。
对于危重类型的患者，可能会有肺部的病变，在后期的恢复过程中可能会出现肺纤维化的表现，但是这种表现可以通过肺部功能的锻炼来改善，具体改善的情况还应该具体而定。
现在还有一些研究表明，新型冠状病毒肺炎有可能会侵犯男性的肾及睾丸组织，也有可能侵犯中枢神经系统。