褐黄病会有一些临床症状，首先，是关节病变，本病最严重的并发症是关节病变，与类风湿关节炎不同，本病主要侵犯脊柱和肩，髋等大关节，而手足小关节很少受累。
第二个症状是皮损，由于尿黑酸色素颗粒，沉积于真皮和汗腺内所引起的，多呈褐色、分布于鼻尖、耳和肋骨软骨交界处，也可呈蝶形分布于鼻梁和面颊部、腋窝和会阴部，是富有汗腺的部位，常呈暗褐色或蓝黑色，可使贴近这些部位的衣服染成褐色。
其他症状，部分病人可有心脏瓣膜的病变，主要为主动脉瓣狭窄。