菌血症就是血液内出现了病原微生物，体内多有感染的病灶，细菌在局部大量的繁殖，可以通过人体皮肤或者是体内的破损进入血管，可以在血液内大量的繁殖，细菌可以随着血液循环传播到全身。
脓毒症主要见于严重感染的患者，细菌可以分泌毒素，毒素进入人体后可以导致全身的器官发生损害。毒素还可以诱发全身性的炎症反应，可以导致重要脏器的功能失调，甚至衰竭。
毒素还可以导致人体免疫功能下降，不能有效的清除体内的病原体和毒素，因此需要早期治疗。