电子胃镜是目前消化道疾病的常用检查方法，主要用于以下疾病的检查。
第一、食道部位的疾病。像食道的炎症、食道的溃疡、食道的癌症等等。通过胃镜检查，可以发现病变的部位、病变的程度，癌症患者还可以在胃镜下取活检，明确癌症的细胞学类型，从而指导后期的治疗。
第二、胃部的疾病。包括胃部的炎症、胃部溃疡、胃部的肿瘤等等。这些疾病通过胃镜检查，也可以明确病变的部位、病变的程度，通过病变部位取活检，还可以明确癌症的细胞学类型。对确定后期是手术还是采用放疗、化疗，都有重要的指导意义。
第三、十二指肠的疾病。像十二指肠的炎症、十二指肠的溃疡、十二指肠的肿瘤等等。
第四、上消化道出血。像溃疡引起的胃出血，肝硬化引起的胃及食道静脉曲张破裂导致的出血，都可以通过胃镜检查，明确出血的部位，而且可以直接在胃镜下进行止血治疗。