排卵期有褐色分泌物的原因，主要是排卵期的时候体内的雌激素水平发生变化，而导致的子宫内膜剥脱出血，也就是排卵期出血。
因为排卵期排卵过后，卵泡液流入盆腔，体内的雌激素水平会出现短时间的下降，就会导致撤退性内膜出血，一般出血量比较少，所以会出现少量的褐色分泌物。雌激素水平下降后，大多数在48小时之后又会上升，所以出血又会自行停止。
如果排卵期出血量比较少，持续时间短，并不需要进行特殊的治疗。如果持续时间比较长，出血量比较多，而且反复发作，就应该进行调理，可以补充性激素。包括雌激素或者雌孕激素的复合制剂，比如短效口服避孕药，都能够起到比较好的治疗作用。