腔隙性脑梗塞，需要按时规律的服用脑血管疾病的二级预防药物。如抗血小板聚集的药物：阿司匹林或氯吡格雷，以及调制稳定斑块的药物，如辛伐他汀或阿托伐他汀等。
同时，配合营养神经的药物，如胞磷胆碱钠或神经节苷脂，以及改善脑循环的药物，如血塞通软胶囊、脑心通胶囊等对症治疗。除了药物治疗以外，需要积极控制脑血管疾病的危险因素。
因为腔隙性脑梗塞的主要病因是由于动脉粥样硬化所致，而高血压、糖尿病、肥胖、高脂血症等疾病，是引起动脉粥样硬化的主要原因。因此，需要积极控制血压、血糖、血脂的平稳，才能有效降低脑血管疾病的发生率。