肺吸虫病的诊断主要是根据病史、个人不良的饮食习惯、临床表现，以及辅助检查结果等。
患者大多有生食螃蟹等不良饮食习惯，会出现咳嗽、胸痛、咳铁锈色痰、发热、腹痛、腹泻、腹胀等临床症状，在患者进行胸部X线片或者CT、核磁共振检查时，有明显的异常检查结果。
尤其在患者进行痰液、粪便以及体液的病原学检查时，可以检查到寄生虫的虫卵或者虫体，或者进行病理活组织检查时，有明显的虫卵、成虫，基本上可以对肺吸虫的病情作出明确的诊断，所以病原学检查对诊断有着重要的意义。