结肠镜检查当日，检查前不可以吃饭。一般结肠镜检查前2~3天应进食少渣饮食，检查前1天以流质饮食为主，如米粥、藕粉、牛奶等，检查前8小时开始禁食，按照要求的时间和剂量服用清肠药物，并按照要求饮入足够量的液体，以排出淡黄色透明水样便为准。
此外，保持空腹状态，不耐饥饿者或糖尿病患者可饮少量糖水。如需进行无痛结肠镜检查，术前4个小时还应禁食水。婴幼儿和年老体弱者应反复进行肠道准备，以防脱水、电解质紊乱必要时应予静脉输液。
肠镜检查后，如未进行内镜下活检和治疗，待患者完全清醒后，没有腹痛腹胀即可进食。