起床后出现肾疼，往往见于：
1.泌尿系统的感染，主要是肾盂肾炎，可以伴有寒战、高热、尿频、尿急、尿痛及明显的腰疼和肾区的叩击痛。严重者由于并发的肾周围炎和肾周积脓、积液时肾疼会更加明显，需要进行超声的检查和血尿常规的化验，给予抗炎治疗后可以缓解。
2.当泌尿系统有结石存在时，如肾结石、输尿管结石等会引起肾区的疼痛，会引起复杂性的尿路感染，伴随尿路刺激症状及肉眼的血尿等。需要进行泌尿系统的超声检查，明确结石的部位，给予合理的治疗。
3.肾脏存在占位性病变时，由于肾脏的体积增大，也会出现肾区的疼痛，如巨大的肾囊肿、肾肿瘤等。需要进行CT的增强扫描。
4.当身体过于劳累，尤其是重体力劳动者会出现肾区的疼痛，如腰肌的劳损、腰椎间盘的突出等。需要进行X线检查，明确诊断。