肺部出现真菌感染，应该予以积极的抗真菌治疗，疗程比较长，一般为6到12周，还可能会更长，要根据病情来决定。
特别是烟曲霉感染时，它会发生威胁生命的大咯血，还要予以止血治疗。如果内科止血效果比较差，还需要进行外科手术治疗。对于效果不好的真菌感染，还可以酌情使用糖皮质激素或者使用β2受体激动剂或者抗胆碱能药物，来缓解喘息、气急的症状。
真菌感染它是一种机会性感染，很少见于正常人，一般是因为免疫力低下更容易感染真菌。所以在平常也要多吃增强抵抗力的食物，比如富含蛋白质的食物和新鲜的蔬菜水果。