细菌感染并不是引发慢性咽炎的主要病因，而是导致急性咽炎发作的病因。慢性咽炎主要是由于以下几类因素导致的：
第一，首先，细菌感染有可能会造成急性咽炎、急性鼻炎、急性扁桃体炎等上呼吸道感染性疾病出现，而上述疾病在发作后，患者如果没能及时的使用足量的抗生素类药物进行治疗，导致病情反复发作，炎症不能有效控制，就会诱发慢性咽炎的情况出现。
第二，长时间处于过度干燥的气候环境中或者是经常吃辛辣、刺激性的食物，工作或生活中经常接触粉尘或者是甲醛等有害气体，也有可能会导致慢性咽炎发生。