男性不孕不育的治疗方法，以对因治疗为主。病因难以确定的，以对症治疗为主。最终通过不同的治疗手段来达到恢复生育能力的目的。治疗方法有以下几种：
1.药物治疗，比如溴隐亭、克罗米芬治疗少精子症，HCG和HMG合用可治疗促性腺激素低下症。
2.外科男性不育的治疗，因为一些先天性的原因引起的，比如隐睾或者尿道下裂行手术治疗，比如进行隐睾下降固定，或者进行尿道下裂的成型手术。还有很多采用显微外科技术，通过对男性生殖系疾病的治疗，让男性恢复生育的能力，比如输精管的显微外科吻合术、附睾管与输精管的显微外科吻合术。
3.免疫治疗，应使用免疫制剂减少抗精子抗体的产生。
4.同时改掉不良的生活习惯，增强体质，应戒烟、戒酒、忌辛辣制品，加强营养，进行适度的体育锻炼。夫妇性生活需适度、有效、和谐。