在通常的情况下，呼吸性碱中毒和呼吸性酸中毒的症状是有着显著的区别的。
首先，患者的呼吸状态不同。呼吸性碱中毒时患者的呼吸较为频繁、较为快，而且较为浅。而呼吸性酸中毒，通常患者呼吸的频率较为慢，较为深、较为大，这是二者的症状上的本质区别。
另外，呼吸性酸中毒存在换气功能不足，因此会出现气促、发绀、胸闷、头痛等临床症状和表现。而呼吸性碱中毒通常是呼吸中枢受抑制而表现的，在临床的症状上突然由深快转为快浅、短促，甚至会出现叹息样的呼吸，这种情况通常提示预后不良。
另外，呼吸性酸中毒患者会有明显的神志变化，有嗜睡、倦怠、神志不清、谵妄甚至昏迷。而呼吸性碱中毒患者由于组织缺氧，有头晕、头痛、精神症状，伴随着口周和四肢麻木、针刺感，甚至出现四肢肌肉的痉挛、抽搐。