女性在怀孕5个月查出肾炎，如果是病情比较轻，尿蛋白少，及时给予消炎、保护肾功能的药物进行处理，病情稳定的可以先暂时观察。
如果是肾炎比较严重导致了大量蛋白尿、高血压、水肿等发生，这时候经医生进行评估后，也要及时地给予终止妊娠处理。
因此当女性在怀孕5个月查出肾炎的时候，有可能是在孕前就有该病没有及时发现有关，另外也可能是在怀孕后引起的肾炎。如果肾功能受损严重，为了孕妇的健康，需要综合评估后做出治疗方案。