肛瘘切除术后，一般要在创面完全恢复以后就不再流分泌物，一般是要在3周~1个月左右的时间。
随着手术创口的修复，分泌物也会逐渐地减少，在创面完全恢复以后，伤口的皮肤组织完全覆盖以后，就不会再有分泌物的分泌。低位单纯性的肛瘘不流分泌物的时间在3周左右，高位复杂性的肛瘘不流分泌物的时间在1个月左右。
肛瘘切除以后创面有分泌物属于正常的恢复过程所伴随的症状，主要就是通过换药以及局部坐浴的方法进行清除，同时要在肛门的局部垫柔软的纸巾，使分泌物附着在纸巾上。并且要及时对纸巾进行更换，避免分泌物在伤口处过长时间停留。