核酸检测肛拭子指的是采集肛拭子的标本进行新冠病毒核酸的检测，通过临床接触的病例，一些无症状感染者或轻症感染者感染后恢复得很快，可能3~5天，咽部核酸就检测不到了。但是一部分新冠感染者粪便或肛拭子核酸阳性持续的时间要比上呼吸道核酸阳性持续的时间长，因此就增加了肛拭子的核酸检测。这样能够提高感染者的检出率，减少漏诊的几率。
但是因为肛拭子的采集不如咽拭方便，因此目前只对隔离点等重点人群使用，并同时采集咽拭和肛拭，必要的时候还会增加血清抗体的检测。因为血清抗体持续的时间会更长，大部分可以超过半年。总之，都是为了提高检出率，降低假阴性的概率。