怀孕出血和来月经出血的区别主要在于是否有停经的病史，一般对于月经周期规则的女性来说，当月经超过以往正常月经周期7天以上的时候，就要考虑有妊娠的可能性。在停经5到6周的时候，怀孕的女性往往可以通过尿妊娠试纸检测出怀孕。超声检查，一般也可以看到宫腔内的妊娠囊了。
如果是已经确认为怀孕再出现有阴道出血，则认为是先兆流产。如果是月经来潮，如果有些女性由于月经不规则，出现月经的推迟，这种情况造成的不能分辨是怀孕还是还是月经来潮，也可以通过血或者是尿的激素水平的测定来进行判断。
血中的绒毛膜促性腺激素的水平，可以较为敏感的较早的来确认是是否怀孕状态。因此是月经还是怀孕以后引起的出血，通过激素水平的测定，就可以进行判断了。