睾丸囊肿对生殖功能的影响，取决于囊肿的大小以及是否伴随感染、损伤等。
较小的囊肿无损伤以及无感染，对生殖功能无影响。由于小囊肿对睾丸无压迫刺激，也不影响睾丸性激素分泌以及精子的生成，既不影响性功能正常发挥，也不影响生育。
但是较大的囊肿，即使无感染、无损伤，对睾丸可能造成压迫刺激，有可能影响性激素以及精子生成，出现性欲望低下、性功能减退以及不孕、不育等。需要结合彩超、精液常规、性激素化验检查，综合评估后，必要时需要囊肿手术切除。