新生儿十二指肠梗阻不是一定要做手术的，这主要取决于患者十二指肠梗阻的原因。
如果是先天性的十二指肠梗阻，这是必须要通过进行手术来缓解病情的，这种先天性的十二指肠梗阻，一般又称为十二指肠闭锁，患儿的手术风险是比较大的，并发症也是比较多的。
因此，患儿一定要到正规的大型医院进行手术治疗。而如果是因为吃东西消化不良而导致的十二指肠梗阻，则不一定需要进行手术，只需要进行禁食、补液等对症支持治疗，很多患儿在一般3到5天左右便可以缓解症状。除非患儿经过内科保守治疗无效，才考虑进行手术。