狭颅症的症状主要有头颅的畸形，因过早闭合的颅缝不同，它的症状会有所不同，如果一侧冠状缝过早闭合会引起斜头畸形，两侧的冠状缝过早闭合会形成短头或扁头畸形，矢状缝过早闭合会形成舟状头或者长头畸形，所有的颅缝过早闭合，则会形成尖头畸形或者塔状头。
患者由于颅腔过小，还会引起颅内压增高的症状，表现为头痛、呕吐、视乳头水肿等，晚期还会发生视神经萎缩、视野缺损、甚至失明等等，患者的颅腔过小，会影响大脑的发育，导致大脑功能的障碍，表现为患儿智力低下，精神萎靡或者容易激动，有些可能会出现肢体的抽搐、癫痫发作表现。
有些患者还会出现眼部的体征，比如说引起突眼以及斜视，还有些患者会合并身体其他部位的畸形，比如会合并腭裂、唇裂及脊柱裂等。