目前川崎病的原因不明，根据以前有这种流行以及有家族发病情况，临床上又有许多表现酷似急性感染，提示该病可能有病原菌的存在。
男婴发病比女婴要多，日本发病率是比较高的，但至今也没有找到直接导致该病的病原体，所以说感染的说法目前还不能够确立。 在所有的病原菌中最受关注的是链球菌，但是到目前为止也没有得到链球菌感染证据，也有人提到一种在禽畜间致病的病菌，但是也没有得到相关证实，所以说对于川崎病的病因，在目前来看仍然不详细。
川崎病在临床表现上一开始主要就是发热，一般发热时间在五天以上，就是出现淋巴结的肿大，一侧或者双侧非化脓性的淋巴结肿大，在数日内后消退，有的会误诊为腮腺炎，淋巴结肿大仅限于颈前三角，不痛，很少波及其他部位。