腹膜炎可选择使用第三代头孢菌素，其用法是提倡使用单一抗生素治疗，如头孢噻肟、头孢哌酮、头孢曲松，必要时可与奥硝唑等药物联合使用。
腹膜炎主要是先找出致病的病原菌，通常它的病原菌是大肠埃希菌和厌氧菌，主要是杆菌。必要时可以去医院做细菌培养，然后通过药敏试验科学选药。
腹膜炎的形成往往是由于刺激而形成严重的腹膜炎，甚至是板状腹膜炎，需要在原发病积极解决之后才能充分诊断腹膜炎的形成，以便进一步控制腹膜炎的症状。