电子肠镜可以检查到小肠。但只能检查一小段末端小肠，大约也就20公分左右。
临床上的电子肠镜主要是用来检查患者的肛门、直肠，以及结肠的疾病。在行电子肠镜的检查过程中，对怀疑有炎症性肠病的患者，会同时进入末端小肠检查，但也只能检查一小段；所以，电子肠镜并不能用来检查小肠。
人体小肠的长度有4~5m，对于小肠的检查可以采用小肠镜或者胶囊内镜；具体患者需要去医院就诊，根据自身的临床症状以及检查目的，再采取相应的检查方法。