生长激素由脑垂体的腺垂体合成和分泌。它这个过程受到下丘脑-垂体这一个系统的调节和控制。如果垂体的发育异常、发育不良，以及有空蝶鞍的现象，还有一些视中隔发育的异常，都可以导致腺垂体的分泌生长激素过程障碍。由于下丘脑的功能缺陷，也会导致生长激素的缺乏。
所以说，它其中的因为神经递质缺陷，也还有一些生长激素生成的合成的基因的缺陷，会出现生长激素的缺乏。总而言之，生长激素缺乏症是由于脑垂体以及下丘脑的功能异常所造成。
它基本上是由先天性造成的，还有一些继发性的分泌不足，主要是由于一些肿瘤、外伤以及感染，影响了下丘脑或者垂体。这个继发性的生长激素缺乏，也会出现在儿童时期。