甲状腺机能减退是甲状腺无法产生足够多的激素，来维持机体正常的生命活动的一种临床综合征，任何可以使甲状腺无法分泌正常数量的甲状腺激素的原因，都是疾病的直接致病因素。
如最常见的缺碘就可以使甲状腺无法合成正常的甲状腺激素，从而导致甲状腺机能减退。除此之外，也有可能是垂体和下丘脑部位的病变，无法产生促甲状腺激素释放激素和促甲状腺激素，这样也会影响到甲状腺激素的合成和分泌。
另外，甲状腺激素分泌不足也和自身免疫病变存在着直接关系。当内分泌失调时，内环境出现紊乱，无法正常产生激素，也会产生甲状腺机能减退症。