疱疹性咽峡炎一般经过5~7天的治疗后可以痊愈。疱疹性咽峡炎是肠道病毒，例如柯萨奇病毒，感染呼吸系统导致的急性疾病。
本病多见于小儿，可能在幼儿园等地区发生聚集性疾病。本病患者往往会出现发热，部分为低热或者中热，少数患儿会出现严重的40℃以上的高热，甚至出现惊厥，也有部分患儿会出现咳嗽、流涕等呼吸道症状和呕吐、腹泻等消化道症状。
除了全身症状外，疱疹性咽峡炎患者还会有咽部症状，包括咽峡部疱疹和咽部疼痛等。