新生儿并发肛周脓肿在临床上也比较多见。主要原因有两个：
第一，新生儿内激素水平一过性增高，这主要是雄性激素，是由母体带来的，过高的激素，可以使肛门周围的腺体发达，分泌旺盛。而肛腺在分泌过程中，一旦因某种原因受阻，就会引发局部感染。
第二，小儿肛门直肠局部的免疫结构尚未发育成熟。主要是肛直角交界处的齿线。当不注意局部清洁卫生或患上一些引起机体抗力下降的疾病，就会打破这里的免疫屏障，从而引发肛周局部感染。