肛门流黄水，首先考虑有肛瘘的存在。肛瘘通过瘘管和肛内相通，肛内的液体会从外口排出到肛门外，就会表现为流黄水的情况。
另外，还有一部分痔疮比较严重的患者，由于痔疮的环形存在，可能会使肛门口闭合不严。在括约肌松弛的状态下，可能会发生肛门流黄水的表现。
另外，由于肠道内有一些增生性疾病所引起，比如有肠息肉或者肠道肿瘤存在的情况下，可以刺激肠道内的分泌物增加，并且可以使肛门口的闭合不严，进而会表现为肛门流黄水的情况。建议患者早到正规医疗机构的肛肠科进行检查，通过肛门局部的检查，一般就可以明确诊断。