怀孕5个月肚脐疼分为生理性因素和病理性因素，生理性因素是由于随着子宫的增大，腹部张力增大，而肚脐作为腹部的薄弱点，有可能因为腹部张力增大受到过度牵拉，继而导致肚脐疼痛的情况出现。在妊娠晚期，肚脐的部位还有可能逐渐凸起。
除此以外，病理性情况多见于消化道疾病。例如胃肠炎有可能因为肠道蠕动增多，从而引起肚脐周围疼痛，但还伴随呕吐、腹泻等相关症状出现。
如果只是单纯肚脐疼痛一般不用特殊处理，但如果是消化道疾病引起的脐周疼痛，建议进行相关的抗炎治疗，避免因为频繁肠道痉挛而诱发宫缩引起流产。