小儿松果体取得肿瘤可以导致小儿出现头痛的症状，松果体瘤增大之后可以对局部的组织造成压迫，可以使颅内的压力升高，所以患儿会出现头痛的症状。随着肿瘤的逐渐增大，患儿头痛的症状会逐渐的加重。
松果体瘤还可以导致儿童出现性早熟，部分患儿还有可能会出现性征停止发育。有些患儿还有可能发生尿崩症，因为肿瘤在生长的过程中会对下丘脑造成破坏。
有些患者的松果体瘤还可以压迫双侧的椎体术，患者可以出现癫痫的发作。有些患儿可以出现听力的下降，有些患儿还可以会出现共济失调。