1.是由于胃内容物或者含有胆盐、胆汁的十二指肠液反流到食管，引起食管粘膜损伤所造成的。
2.反流性食管炎具体的病因包括抗反流屏障功能降低以及食管廓清能力降低。抗反流屏障功能降低最常见于食管括约肌压力低下。食管括约肌压力降低是引起反流性食管炎的主要原因。
2.在生理情况下当有吞咽动作时，食管括约肌会反射性松弛压力下降。通过正常的食管蠕动，推动食物进入到胃内，然后又恢复到正常水平，并且出现一个反应性的压力升高以防止食物反流。
3.当胃内压和腹内压升高时，食管括约肌会发生反应性主动收缩，使其压力超过升高的胃内压起到抗反流的作用。如果因为某种因素，使这种正常的功能发生紊乱时就会引起胃内容物反流到食管。食管括约肌周围组织作用减弱，常见于缺少腹腔段食管致使腹内压增高时不能传导腹内压到食管括约肌使之收缩达到抗反流的作用。也可见于小婴儿食管角较大，横隔角的钳夹作用减弱或者膈食管韧带以及食管下段粘膜解剖结构发生器质性或者功能性病变等。