做脑部CT不会引起患者出现头疼的症状。做脑部CT对人体的副作用主要是CT对人体的辐射作用，因为CT利用的是放射线对人体进行断层扫描，所以对人体或多或少会有一定的辐射。
但是，偶尔做一次CT对人体的辐射作用也没有那么强，因为每一次辐射的量都远远低于国家的安全值，一年一般不超过两次CT检查都是没有问题的。有些患者因为病情的需要可能要多次做CT，此时相对于诊断和治疗疾病，它的利也是大于弊的。
患者引起头疼，建议患者再做一下其他的检查，查找一下头疼的原因，以免耽误疾病的治疗。比如患者看下是否有高血压、脑梗塞或者是颈椎病等其他的问题。