治疗睾丸萎缩，应根据引起睾丸萎缩的原因进行针对性治疗，并不一定吃中成药。
如果睾丸萎缩是因为局部感染所引起，比如睾丸炎应当进行抗感染治疗。如果是因为睾丸缺血或者局部血液循环不畅所导致，应当服用活血以及改善血液循环的药物来进行调理。如果是由于内分泌异常、雄性激素过少所引起的睾丸萎缩，可通过药物补充雄激素，比如十一酸睾酮。
在治疗期间，患者应多休息，不要过度运动，也不要进行性生活，在饮食上应当以清淡为主。