打完新冠疫苗后小腿疼，多与患者过度疲劳有关，如长期慢性劳损、剧烈运动等导致腿部肌肉发生劳损拉伤引起，在机体注射疫苗后由于身体的适应过程，可能会导致原来腿部肌肉的劳损加重，出现小腿疼痛的症状。
当然，单纯注射新冠疫苗不会引起小腿疼痛，建议患者先注意休息，密切观察患处，如果不能及时消退再去医院进行治疗。
另外，如果小腿部位的关节患有炎症，如膝盖、踝关节等处，在注射疫苗后身体会有一定的免疫过程，这期间也可能会引起关节炎症出现疼痛症状，待注射疫苗3~5天后再考虑用药缓解疼痛症状。