子宫腺肌症治疗后是否会出现后遗症，以及后遗症的严重程度是要视具体的治疗方法而定的。
对于子宫腺肌症，如果只是采用一般的保守治疗只能起到暂时缓解症状的作用，不能达到治愈的效果。并且保守治疗一般要使用激素类药物，副作用是比较大的。所以要根治子宫腺肌症，目前最常用的方法就是切除子宫。在切除子宫后，除了丧失生育能力以及不再有月经外是没有其它的后遗症。
目前随着医学技术的进展，大多数有生育需求的子宫腺肌症患者，会采用微创手术的方式进行治疗，但这种治疗方式的复发率特别高。