鼻咽癌化疗的副作用需要根据化疗方案的不同会有所不同，
如果使用的是最基础的氟尿嘧啶加顺铂的化疗，可能会出现恶心、呕吐、腹泻、便秘、肾功能损害、骨髓抑制等不良反应。如果使用的化疗方案是多西他赛加顺铂，其不良反应可能有脱发、过敏、恶心、呕吐、全身乏力、骨髓抑制、白细胞下降等。每个人出现的化疗反应会有所不同，有些轻，有些重。鼻咽癌最常见的症状就是回吸性血涕、耳鸣、头痛、上颈部肿大淋巴结。
鼻咽部的CT和磁共振可以发现鼻咽部的病灶，以及颈部有无肿大的淋巴结，鼻咽镜取得活组织做病理检查，可以明确诊断。