一般来说小儿先天性肾积水可以在胚胎时期行B超检查时发现，B超下可见肾盂扩张，积水严重时可出现肾盏扩张，这时可诊断为肾积水。
此外还可以通过双肾核磁共振检查发现，其优势为没有射线。
再就是CT检查，但CT检查有射线，小儿只有在无其它手段时才选择。
诊断肾积水最常用的手段为双肾彩超，无辐射，可于孕期和小儿时期检查对比。如果超声提示肾盂扩张超过4-5mm，出生之后需要定期随访。引起小儿出现先天性肾积水的原因，就是因为肾盂输尿管连接部位出现狭窄。