儿童的心肌炎绝大部分是病毒性心肌炎，这种病毒性心肌炎大部分有自限性，经过积极的治疗，大部分的患者可以痊愈，而且不会复发。
但是有极少部分的儿童病毒性心肌炎，经过治疗好转以后，在长大后还会由于病毒感染而导致病毒性心肌炎的复发。
另外有一部分的病毒性心肌炎，可以转为慢性心肌炎，而逐渐进展为扩张型心肌病，造成心脏扩大、心肌收缩力下降，引起各种类型的心律失常，从而导致病情逐渐加重，反复发作，预后不良。