手足口病有可能会反复发作，因为每次感染的病毒类型可能会存在一定的差异。
患者感染一次手足口病后，机体可能会针对该类型的病毒产生抗体，但是对于其他类型的肠道病毒没有免疫作用，因此有可能会出现反复发作。尤其是机体免疫力下降，并且有密切接触手足口病患者时，感染肠道病毒引起手足口病的可能性更大。
该疾病虽然是一种传染病，相对传染性较强，但是也属于一种自限性疾病。部分普通病例的患者没有出现严重并发症时，可以达到完全自愈。